(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
http://www.cse.ucsc.edu/research/compbio/sam.html

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • Q9NQS7|INCE_HUMAN Inner centromere protein - Homo sapiens (Human).
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    • gi|122132085|sp|Q076A4|MYH8_CANFA Myosin-8 (Myosin heavy chain 8) (Myosin heavy chain, skeletal muscle, perinatal) (MyHC-perinatal) (Developmental myosin heavy chain neonatal) [Taxonomy]
    • gi|83026766|gb|ABB96410.1| developmental myosin heavy chain neonatal [Canis familiaris]
    • gi|73955718|ref|XP_861205.1|_357:1173 PREDICTED: similar to Myosin heavy chain, skeletal muscle, perinatal (MyHC-perinatal) isoform 2 [Canis familiaris]
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    • gi|4808815|gb|AAD29951.1| myosin heavy chain IIx/d [Homo sapiens]
    • gi|114669070|ref|XP_001165174.1|_476:1295 PREDICTED: myosin, heavy polypeptide 8, skeletal muscle, perinatal isoform 1 [Pan troglodytes]
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    • gi|119610414|gb|EAW90008.1|_466:1285 myosin, heavy polypeptide 8, skeletal muscle, perinatal, isoform CRA_a [Homo sapiens]
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 756 ...--..--.-.....-.---.....-.-------------------------------------
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 761 ...--..--.-.....-.---.....-.PEPAQTLTEKATEGPEAHGAEEEPRSGERVEDKQLEQ
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 779 ...--..--.-.....-.---.....-.PVKAESQAPAASQPSEPHPVLIPSININSETTENKEE
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 240 .ElyaeaEEM.RVR.....LA.A.....KKqEL...E..EI...L.....H..E..ME.....-.
 241 .ElyaeaEEM.RVR.....LA.A.....KKqEL...E..EI...L.....H..E..ME.....-.
 242 .K.....LRM.DLE.....RV.K.....RK.LE...G..DL...K.....L..A..QEsimdlE.
 243 .K.....LRM.DLE.....RA.K.....RK.LE...G..DL...K.....M..S..QDtimdlE.
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 576 A.....Cr.E....E....FHR....RL.....KV..Y...H..A.....WKS..Knk8etEQR.
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 580 H.....L..N....T....IQKm...RC.....EL..I...K..L.....QHQ..T.....ELT.
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 582 -.....-..-....-....---....--.....--..-...-..-.....---..-.....---.
 583 El91sqQ..S....Q....LQR....EA.....DD..A...K..K.....LLQ..A.....RL-.
 584 El91sqQ..S....Q....LQR....EA.....DD..A...K..K.....LLQ..A.....RL-.
 585 -.....-..-....-....---....--.....--..-...-..-.....---..-.....---.
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 590 R.....Q..H....E....ATR....ELe13raEL..T...R..L.....QHQ..T.....ELG.
 591 R.....Q..H....E....ATR....ELe13raEL..T...R..L.....QHQ..T.....ELG.
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 595 R.....Q..H....E....ATR....ELe13raEL..T...R..L.....QHQ..T.....ELG.
 596 A.....Cr.E....E....FHR....RL.....KV..Y...H..A.....WKS..K.....NKK.
 597 A.....Cr.E....E....FHR....RL.....KV..Y...H..A.....WKS..Knk8etEQR.
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